Zdanie jest jak najbardziej poprawne gramatycznie, zmienia się tylko jego znaczenie w stosunku do Present Perfect. Używając Past Perfect zaznaczamy, że stało się to przed jakimś innym przeszłym wydarzeniem. Na przykład: "Little Maggie didn't know what to do. She had only just arrived in London. There she was, all alone, standing right in the middle of Victoria station. She was scared."

Dokładnie tak jak tłumaczy HandicapGuy - zdanie będzie poprawne gramatycznie, ale znaczenie będzie nieco inne. Na język polski przetłumaczymy oba zdania tak samo - dopiero co przyjechała do Londynu - a to dlatego, że nie mamy już czasu zaprzeszłego, ale znaczenie obu zdań jest dość istotne:

Zdanie z Past Perfect bardzo ładnie zobrazował HandicapGuy - ona dopiero co przyjechała, ale cała historia opowiadana jest w czasie przeszłym, ona nie wiedziała co robić, bo przyjechała - przyjechała nieco wcześniej, niż moment, w którym nie wiedziała co robić.

Z kolei zdanie z Present Perfect mogłoby być postawione np. w podobnej historii opowiadanej w czasie teraźniejszym, albo np. gdy poznam jakąś osobę na dworcu i ktoś mnie spyta, czemuż ona taka zagubiona - "Oh, she has only just arrived in London" - dopiero co przyjechała.

Mamy tu coś podobnego w przykładowych zdaniach w słowniku etutor. Hasło: breast cancer. Przykładowe zdanie:
I had just been diagnosed with breast cancer. (Właśnie wykryto u mnie raka piersi.) Przerabiając powtórki dostaję do przetłumaczenia polskie zdanie. Odruchowo używam Present Perfect (nie ma żadnego kontekstu) i zaliczam złą odpowiedź. No i co z takimi powtórkami robić? Po prostu dodać sobie notatkę z czasem w jakim ma być odpowiedź?
A może jest na to jednak jakaś reguła?