Jeśli chodzi o drugą uwagę to ja rozumiem ją w ten sposób, że "not" wystąpi po podmiocie wtedy, gdy nie będziesz chciała użyć formy skróconej, ale jeśli ktoś ma inne zdanie na ten temat to oczywiście chętnie się z nim zapoznam :)
Pozdrawiam

Moim zdaniem jest tak:

W pytaniach o podmiot jest i tak wszystko jedno, bo tam "not" występuje w bezpośrednim sąsiedztwie czasownika posiłkowego:
Who is not at school today?=Who isn't at school today?
Who cannot swim? Who can't swim?
Who doesn't have a pet? Who does not have a pet?
Who did not know the rule? Who didn't know the rule?
Who will not come to school tomorrow? Who won't come to school tomorrow?
Who is not listening to me? Who isn't listening to me?
Nie ma żadnej trudności.

W pytaniach o dopełnienie, a ściślej mówiąc również o okoliczniki, problem powstaje przez to, że podmiot ma tam swoje miejsce po czasowniku posiłkowym i wtedy powstaje pytanie, gdzie wcisnąć to nieszczęsne "not". Odpowiedź logiczna: po podmiocie, jeśli w pełnej formie; razem z czasownikiem posiłkowym, czyli przed podmiotem, jeśli w formie skróconej:

Who didn't you invite to the party?, ale: Who did you not invite to the party?
Who don't you love?, ale: Who do you not love?
Where haven't you been?, ale: Where have you not been? itd.

Choć tu się obawiam, że na przykład w przypadku niektórych czasowników modalnych to nie będzie równoznaczne. czy np. "What couldn't you do (when you were five)?" (Czego nie potrafiłeś/ nie mogłeś robić) to to samo, co "What could you not do (when you were five)?" (Czego mogłeś nie robić? - np. nie sprzątać po sobie). Hm.