Reguła następstwo czasów: "myślałem" a zatem kiedyś, przedtem zanim wypowiadam to zdanie a więc wtedy tak pomyślałem dlatego czas przeszły "were".

podobne zdanie:
https://www.etutor.pl/pytania-jezykowe/pytanie/203709-I_thought_you_were_right-handed_-_Myslalem_ze_jestes_praworeczny.html?unread

Czasem ten Angielski wydaje mi się dziwny.
>First I thought you were a dancer
Przyzwyczajony do polskiej gramatyki, tłumaczył bym to tak: Na początku myślałem że byłeś tancerzem.

Cóż, trzeba nauczyć się przestać mysleć po polsku ;)

Z tego co zrozumiałem, "were" używamy dlatego, że używając wcześniej słowa "thought" myślałem przenosimy całą akcję / całe zdanie w przeszłość:
wtedy myślałem że byłeś tancerzem.
Błędem byłoby powiedzieć:
wtedy myślałem że (teraz) jesteś tancerzem. bo jak przeniesiesz się w czasie do przeszłości to nie powiesz, że w tamtym czasie (w przeszłości) myślałeś, że (teraz/w teraźniejszości) on jest tancerzem.

PS. Może trochę pokrętnie to tłumaczę, ale to jest pokręcone ;)