Słusznie kojarzy Ci się z "ever" czasownik "have" i trzecia kolumna, bo "ever" jest dość charakterystyczne dla czasów Perfect. Zdania z "have" i (jak to nazywasz) trzecią kolumną są w czasie Present Perfect, który służy m.in. do opisywania przeróżnych sytuacji na styku teraźniejszości i przeszłości, m.in. gdy coś się zaczęło w przeszłości i trwa aż do teraz:

It is the longest conversation they have ever had. (aż do tej pory - do teraz - nie odbyli tak długiej rozmowy).

W Twoim zdaniu ta najdłuższa rozmowa odbyła się w przeszłości (czas przeszły prosty - Past Simple), a nigdy przed nią nie było podobnej (czas zaprzeszły - Past Perfect):

It was the longest conversation they had ever had. (aż do tamtej pory - wtedy, w przeszłości - nie odbyli tak długiej rozmowy).