Te zdania różnią się miedzy sobą konstrukcją czasową i jej zastosowaniem. Pierwsze zdanie które przytoczyłaś i które jest poprawne jest wyrażone w Present Perfect, posiada okolicznik czasu - "yet" - który jest charakterystyczny dla czasu Present Perfect. Drugie zdanie które przytoczyłaś jest niepoprawne gramatycznie ze względu na zastosowany tu przez Ciebie okolicznik czasu - "yet". Do momentu zastosowania słówka "yet" w drugim zdaniu, wszystko jest w porządku. Możesz zatem powiedzieć: Has she gone home yet? lub Did she go home? Jednak drugie zdanie jest już w innym czasie, jest to czas Past Simple. Te dwa czasy : Present Perfect i Past Simple różnią się pomiędzy sobą nie tylko konstrukcją ale też użyciem w odpowiedniej dla danego czasu chwili i nie maja z sobą nic wspólnego. Present Perfect to czas który swoją przeszłością nawiązuje do teraźniejszości (nie jest to czas przeszły) natomiast Past Simple to czas przeszły - w skrócie mówiąc: coś wydarzyło się w przeszłości i nie ma już od tego odwrotu. Czas ten nie ma nic wspólnego z teraźniejszością. To jest główna różnica pomiędzy tymi czasami jak i również tymi dwoma zdaniami które podałaś. Warto zwracać uwagę na okoliczniki czasu, ponieważ one bardzo dużo mówią nam o zastosowaniu danego czasu.
Pozdrawiam serdecznie.