Was stosujemy dla 1 i 3 osoby liczby pojedynczej czyli I, she , he it
Were dla pozostałych czyli you, we, they ( 2 osoba liczby pojedynczej you i wszsytkie osoby liczny mnogiej).

Twoje przykłady jasno określają dlaczego użyto was/ were


1. I heard that you were ill last week.= Słyszałem, że byłeś chory w zeszłym
tygodniu.

byłeś =czyli you were ( czas Past Simple)

2. She said that she was busy. = Ona powiedziała, że była zajęta

była= she was

3. At 8:30 they were studying at school. = O wpół do dziewiątej oni uczyli się w szkole.

they were studing= oni uczyli się

Mam propozycję abyś wrócił/a do czasów tych podstawowych czyli Present Simple, Past Simple i Present Perfect.